En los considerandos, el Tribunal de Cuentas da cuenta de una resolución de mayo de 2000 por el Consejo Superior Interministerial del Túnel que por Santa Fe firmaron los entonces ministros Juan Carlos Mercier y Juan José Morín. Allí los ministros de ambas provincias ordenan la ejecución de una auditoría permanente de la Comisión Administradora del Ente, a ser realizada por funcionarios de los Tribunales de Cuentas de ambas provincias. En base a ese pedido, el Tribunal envía una nota al gobernador Carlos Reutemann insistiendo en la necesidad del dictado de una ley provincial para proveer el marco legal para asignar competencia en materia de control externo del Ente. Pero además considera a la decisión del Consejo Superior Interministerial "una aspiración o intención política de los firmantes de proveer al oportuno control externo de Ente interprovincial que podría dar lugar al inicio de la planificación de actividades preparatorias conjuntas entre los Tribunales de Cuentas de Santa Fe y Entre Ríos, a fin de analizar y compatibilizar, en principio, la legislación aplicable al caso".