Mientras fue ministro, Sain conservó su cargo de director del Organismo de Investigaciones del Ministerio Público de la Acusación, bajo la polémica figura de una licencia sin goce de sueldo (otorgada por el fiscal general Jorge Baclini), con lo que mantuvo un pie en el Poder Ejecutivo y otro en el Judicial, al mismo tiempo. Sin embargo, cuando terminó su gestión como ministro y volvió al OI del MPA fue destituido por una sesión conjunta de ambas Cámaras de la Legislatura de la Provincia el 4 de noviembre del año pasado, debido a sus constantes manifestaciones públicas de proselitismo partidario, una actitud que por muy amplia mayoría los legisladores santafesinos consideraron suficiente para su expulsión de la oficina que había creado, por un pedido expreso del ex gobernador Miguel Lisfschitz durante aquel gobierno.